2026년 10월 6일 서울 여의도 국회에서 열린 행정안전위원회 국정감사를 통해 윤호중 행정안전부 장관이 중수청과 관련된 여러 질문에 답변했다. 이 날의 열린 감사에서 박상웅 국민의힘 의원은 중수청이 ‘정권 입맛에 맞는 수사 기관’이 되지 않느냐는 질문을 던졌다. 윤 장관은 이러한 주장에 대해 “추호도 그런 생각이 없다”며 명확히 부인하였다.

윤 장관은 검찰과 중수청 간의 역할 분리 필요성을 설명하면서, 수사권과 기소권이 한 사람 또는 단일 기관에 모두 속해 있던 문제점을 지적했다. 이를 해결하기 위해 검찰의 수사 역량을 분리한 것이라며, 중수청을 행정안전부 아래로 두는 결정은 법무부 내에서 서로 결탁할 가능성을 최소화하기 위함임을 밝혔다. 그러나 이러한 변화가 검찰이 가지고 있던 수사 역량을 완전히 상실하는 것이 아닌가는 의문에 대해 국민의 다양한 견해를 인정하면서, 두 우려를 모두 충족시키기 위한 새로운 안을 마련하기 위해 노력하고 있다는 점을 강조했다.

중수청과 고위공직자범죄수사처(공수처)의 수사 영역이 겹친다는 지적에 대해 윤 장관은 공수처에 사건을 이관할 경우, 수사권은 공수처에 있음을 설명했다. 두 기관의 통합 여부에 관해서는 현재 검찰을 기소기관과 수사기관으로 나누었으며, 이후 필요한 경우 공수처와 중수청의 통합 여부를 검토할 계획이라고 밝혔다.

임은정 광주지방중대범죄수사청장이 중수청 출범 준비가 미흡하다는 공개적인 지적에 대해서는 “그러한 내용이 정확하지 않다”고 답변했다. 임 청장은 이날 광주중수청 출근길에서 예산 등의 문제와 간부 부임 관련 어려움을 지적하였으나, 윤 장관은 중수청 차장 인사에 대해 검찰 특례임용 과정을 거쳐 한 사람이 신청한 점과 1급 직급에서의 임명 가능성을 강조했다.

윤 장관은 중수청 출범 준비 수준이 ‘한 3분의 2 정도’ 완료되었음을 평가하며, 과거 특수수사에 익숙해진 검찰 인력은 조작 수사나 암장 수사 기법을 사용할 가능성이 크기 때문에 그들은 검찰에 남겨두는 계획임을 밝혔다. 비검찰 출신으로의 인원 추가 필요성에 대해도 검찰 출신 자체로 불이익을 주지 않겠으나, 특수부 경력자들은 검찰에 남아 있게 될 것임을 설명했다.

중수청 간부의 정치적 중립성 문제를 지적한 의원들에 대해 윤 장관은 확고히 반박하며, 조직 개편 시에 자신이나 그의 부하가 모두 배정된 것이 아니라는 점을 강조하였다. 이어 “윤석열 검찰을 다시 활용할 의도가 있는지” 라는 질문에 대해서도 적극적으로 반박했다.

경찰과 중수청 간의 수사 관할 충돌 시 조정 방안에 대해 윤 장관은 현재 양 기관간 협의를 통해 이뤄지고 있으며, 수사권관할조정협의회가 내년 2월 출범하면 더 나아질 것이라고 밝혔다.

대통령실에서 중수청 특례임용에 개입한 것으로 알려진 사건에 대해서도 윤 장관은 그러한 소문을 부인하며, 인사 과정의 탈락과 철회 사유가 명확하다고 설명했다. 이와 같이 중수청의 출범 및 운영에 대한 다양한 질문들을 윤 장관은 꼼꼼히 답변하여, 새로운 수사 기관의 효율성과 정치적 중립성 보장을 위한 노력이 지속되고 있다는 메시지를 전달하였다.

이러한 국정감사에서의 질의응답은 중수청의 출범 과정과 이후 운영 방향에 대해 국민들에게 많은 안심을 줄 뿐만 아니라, 행정안전부가 새로운 수사 기관의 설립 목표를 단호하게 추진하고 있음을 확인할 수 있는 중요한 순간이었다. 각종 비판과 의문에 대해 윤 장관은 철저하고 사실적인 답변을 통해 과학적이고 정치적으로 무색한 수사 기관의 구축이 가능할 것임을 약속했다.